是表示用元素符號和短線表示化合物（或單質）分子中原子的排列和結合方式的式子，是一種簡單描述分子結構的方法 。結構式不同而化學式相同不一定是同一種物質，其性質也往往不一樣 。物具有相同分子式 ， 但具有不同結構的現象，叫做同分異構現象；具有相同分子式而結構不同的化合物互為同分異構體 。
分子結構的含義：
分子結構或稱分子平面結構、分子形狀、分子幾何，建立在光譜學數據之上，用以描述分子中原子的三維排列方式 。分子結構在很大程度上影響了化學物質的反應性、極性、相態、顏色、磁性和生物活性 。分子結構涉及原子在空間中的位置，與鍵結的化學鍵種類有關 ， 包括鍵長、鍵角以及相鄰三個鍵之間的二面角 。
同分異構體與結構式區別：
化學上 ， 同分異構體是一種有相同化學式，有同樣的化學鍵而有不同的原子排列的化合物 。簡單地說，化合物具有相同分子式 ， 但具有不同結構的現象，叫做同分異構現象；具有相同分子式而結構不同的化合物互為同分異構體 。很多同分異構體有相似的性質 。
【分子結構式 分子結構式虛線】同分異構體又稱同分異構物 。在化學中，是指有著相同分子式的分子；各原子間的化學鍵也常常是相同的；但是原子的排列卻是不同的 。也就是說，它們有著不同的“結構式” 。許多同分異構體有著相同或相似的化學性質 。同分異構現象是有機化合物種類繁多數量巨大的原因之一 。
