1、外觀不同：轉基因大豆呈現亮黃色，非轉基因大豆呈現淡黃色 。而且轉基因大豆要普遍比非轉基因的大豆大，因為是人工培植，其內部的營養成分以及基因和非轉基因不一致 ， 轉基因生產的大豆會更加的飽滿 。2、產量不同：轉基因的大豆產量是非轉基因的數倍 。正因如此，轉基因大豆才收到很多種植機構或者種植戶的青睞 。但是在另一方面，轉基因的大豆的營養并沒有非轉基因的大豆要高 。
3、發芽的能力不同：用水浸泡大豆三天，能夠從發芽程度上進行判斷 。轉基因大豆是不會發芽的，只會變得個體膨脹；而非轉基因大豆就能很清晰的看到芽苗生長出來 。
【轉基因大豆和非轉基因大豆的區別 轉基因大豆和非轉基因大豆的區別論文】4、大豆蟲蛀程度不同：由于轉基因大豆轉入了抗蟲、抗藥的基因 ， 所以轉基因的大豆通常形態整潔，幾乎看不到任何蟲蛀痕跡 。而非轉基因若是保存不當便容易生蟲蛀 。
