1、不耐臟，硅藻泥，大多是淡雅色 ， 容易留下小孩玩耍的各種污跡，雖然網上說用橡皮擦可擦掉，但也有人反映此方法并不見效 。
2、不能擦洗，瓷磚防水，墻壁臟了，可用濕布擦拭，但硅藻泥是納米蜂窩狀結構 ， 吸附性比活性炭高，一旦用水擦拭，起不到清潔的作用 。另外，硅藻泥由于不能用水擦洗，一旦墻面弄臟，不能用水擦洗 。
3、不防水，硅藻泥 ， 不防水，不能用于潮濕場所 ， 比如：廚房、衛生間 。
4、要經常清理，硅藻泥能吸附有害物質，如長時間不清理 ， 會改變墻壁的顏色，令環境骯臟不堪，所以墻壁要經常清理 。
5、手感不佳，硅藻泥，摸起來粗糙，并沒有油漆細膩，對于喜歡光滑手感的人來說 ， 硅藻泥略顯劣勢 。
6、花色不夠豐富，與壁紙的花色、色彩、造型相比，硅藻泥肌理圖案單調，不夠豐富 。
7、硬度不好，硅藻泥是“泥”，其硬度與瓷磚無法相比，據了解：用質量不好的硅藻泥 ， 被碰撞后會一塊塊掉下來 。
【硅藻泥缺點 硅藻泥缺點大揭秘案例】8、價格較貴 ， 硅藻泥價格較高，一般在三四百元/平米 ， 普通家庭不會選擇這么貴的材料，所以那就是有錢人的玩意 。
